Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sp140Q6NSQ5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sp140Q6NSQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp140Q6NSQ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp140Q6NSQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp140Q6NSQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms