Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ggnbp1Q6K1E7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ggnbp1Q6K1E7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ggnbp1Q6K1E7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ggnbp1Q6K1E7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms