Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt87Q6IMF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt87Q6IMF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt87Q6IMF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt87Q6IMF0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt87Q6IMF0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms