Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arhgap20Q6IFT4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap20Q6IFT4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap20Q6IFT4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms