Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp7Q6A4J8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp7Q6A4J8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp7Q6A4J8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp7Q6A4J8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms