Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pds5aQ6A026 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pds5aQ6A026 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pds5aQ6A026 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pds5aQ6A026 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms