Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn3Q64691 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn3Q64691 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn3Q64691 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn3Q64691 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms