Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Top2bQ64511 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Top2bQ64511 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Top2bQ64511 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Top2bQ64511 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Top2bQ64511 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Top2bQ64511 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Top2bQ64511 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Top2bQ64511 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms