Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clcn1Q64347 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clcn1Q64347 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clcn1Q64347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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Clcn1Q64347 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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Clcn1Q64347 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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Clcn1Q64347 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clcn1Q64347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
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Clcn1Q64347 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
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Clcn1Q64347 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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Clcn1Q64347 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clcn1Q64347 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clcn1Q64347 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.7 ms