Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim24Q64127 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim24Q64127 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim24Q64127 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms