Protein–RNA interactions for Protein: Q64096

Mcf2l, Guanine nucleotide exchange factor DBS, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcf2lQ64096 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcf2lQ64096 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcf2lQ64096 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcf2lQ64096 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mcf2lQ64096 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcf2lQ64096 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms