Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col4a5Q63ZW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a5Q63ZW6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col4a5Q63ZW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a5Q63ZW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col4a5Q63ZW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms