Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pou4f3Q63955 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pou4f3Q63955 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pou4f3Q63955 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pou4f3Q63955 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms