Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SypQ62277 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SypQ62277 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SypQ62277 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SypQ62277 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SypQ62277 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SypQ62277 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SypQ62277 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SypQ62277 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms