Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfap2bQ61313 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfap2bQ61313 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfap2bQ61313 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tfap2bQ61313 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tfap2bQ61313 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms