Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4Q61107 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp4Q61107 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gbp4Q61107 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4Q61107 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms