Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klf4Q60793 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klf4Q60793 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klf4Q60793 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klf4Q60793 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms