Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Samhd1Q60710 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Samhd1Q60710 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samhd1Q60710 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samhd1Q60710 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samhd1Q60710 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samhd1Q60710 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms