Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ItgaeQ60677 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgaeQ60677 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ItgaeQ60677 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ItgaeQ60677 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgaeQ60677 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms