Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc125Q5U465 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc125Q5U465 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc125Q5U465 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc125Q5U465 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms