Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mfsd3Q5U419 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd3Q5U419 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd3Q5U419 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd3Q5U419 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms