Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim38Q5SZ99 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim38Q5SZ99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim38Q5SZ99 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim38Q5SZ99 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
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