Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsr1Q5SWD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsr1Q5SWD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsr1Q5SWD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsr1Q5SWD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms