Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mks1Q5SW45 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mks1Q5SW45 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mks1Q5SW45 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mks1Q5SW45 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms