Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TefmQ5SSK3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TefmQ5SSK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TefmQ5SSK3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms