Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyb5d2Q5SSH8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyb5d2Q5SSH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyb5d2Q5SSH8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyb5d2Q5SSH8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyb5d2Q5SSH8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms