Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo39Q5NBU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo39Q5NBU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo39Q5NBU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms