Protein–RNA interactions for Protein: Q58Y74

Trcg1, Taste receptor cell protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trcg1Q58Y74 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trcg1Q58Y74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trcg1Q58Y74 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trcg1Q58Y74 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trcg1Q58Y74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trcg1Q58Y74 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms