Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Otol1Q4ZJM7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otol1Q4ZJM7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otol1Q4ZJM7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms