Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BC051142Q3V0M8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC051142Q3V0M8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BC051142Q3V0M8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BC051142Q3V0M8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BC051142Q3V0M8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms