Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
4933416C03RikQ3V063 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933416C03RikQ3V063 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933416C03RikQ3V063 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4933416C03RikQ3V063 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
4933416C03RikQ3V063 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms