Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
D130052B06RikQ3UW13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
D130052B06RikQ3UW13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms