Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1lQ3USQ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1lQ3USQ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Syndig1lQ3USQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syndig1lQ3USQ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms