Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf48Q3US17 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf48Q3US17 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf48Q3US17 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf48Q3US17 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms