Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtl4Q3URY0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtl4Q3URY0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtl4Q3URY0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl4Q3URY0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms