Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mindy4Q3UQI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mindy4Q3UQI9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mindy4Q3UQI9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mindy4Q3UQI9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mindy4Q3UQI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms