Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3UPC7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3UPC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UPC7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UPC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Q3UPC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Q3UPC7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UPC7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3UPC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3UPC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3UPC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms