Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnep1r1Q3UJ81 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnep1r1Q3UJ81 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cnep1r1Q3UJ81 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnep1r1Q3UJ81 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms