Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc34Q3UI66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc34Q3UI66 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc34Q3UI66 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms