Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmem109Q3UBX0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem109Q3UBX0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem109Q3UBX0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem109Q3UBX0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem109Q3UBX0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms