Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf2Q3UAW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brf2Q3UAW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brf2Q3UAW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brf2Q3UAW9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms