Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5A2

Muc3a, Mucin 3A, cell surface-associated (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc3aQ3U5A2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Muc3aQ3U5A2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Muc3aQ3U5A2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Muc3aQ3U5A2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Muc3aQ3U5A2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Muc3aQ3U5A2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms