Protein–RNA interactions for Protein: Q3U552

A930003A15Rik, RIKEN cDNA A930003A15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930003A15RikQ3U552 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A930003A15RikQ3U552 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A930003A15RikQ3U552 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
A930003A15RikQ3U552 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A930003A15RikQ3U552 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms