Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pank2Q3U4S0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pank2Q3U4S0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pank2Q3U4S0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pank2Q3U4S0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank2Q3U4S0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pank2Q3U4S0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank2Q3U4S0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pank2Q3U4S0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms