Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctu2Q3U308 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctu2Q3U308 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctu2Q3U308 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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