Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrn4clQ3TYX2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrn4clQ3TYX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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