Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shcbp1lQ3TTP0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1lQ3TTP0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1lQ3TTP0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shcbp1lQ3TTP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms