Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D17Wsu92eQ3TT38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
D17Wsu92eQ3TT38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
D17Wsu92eQ3TT38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D17Wsu92eQ3TT38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms