Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
9130409I23RikQ3TS87 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
9130409I23RikQ3TS87 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
9130409I23RikQ3TS87 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9130409I23RikQ3TS87 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
9130409I23RikQ3TS87 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms