Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdlim7Q3TJD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdlim7Q3TJD7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdlim7Q3TJD7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdlim7Q3TJD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms